El Programa de Doctorado en Ciencias, mención Ecología y Evolución tiene como objetivos impartir formación científica avanzada en las áreas naturalistas más desarrolladas de nuestro país, para generar científicos integrativos e independientes capaces de realizar investigación original y relevante a nivel internacional. Para ello, la Facultad de Ciencias de la Universidad Austral ofrece un amplio abanico de especialidades ecológico-evolutivas tales como: genética ecológica, conservación biológica, sistemática, ecofisiología animal y vegetal, genómica evolutiva, ecología de comunidades y ecosistemas.